Bóng đá đã là một môn thể thao tại SEA Games kể từ kỳ Đại hội năm 1959. Nội dung bóng đá nữ lần đầu tiên được tổ chức vào năm 1985 tại Thái Lan.
Từ SEA Games 2001 đến SEA Games 2015 và một lần nữa kể từ SEA Games 2021, các đội tuyển nam được giới hạn độ tuổi là U-23, kèm theo tối đa ba cầu thủ trên 23 tuổi trong mỗi đội hình.
Kể từ SEA Games 2017, giới hạn độ tuổi cho các đội nam là U-22. Tại SEA Games 2019, mỗi đội được phép có hai cầu thủ quá tuổi, trong khi các kỳ năm 2023 và 2025 không cho phép bất kỳ cầu thủ quá tuổi nào.
Thái Lan và Việt Nam là hai quốc gia duy nhất đã giành cả huy chương vàng bóng đá nam và bóng đá nữ trong một kỳ Đại hội Thể thao Đông Nam Á. Thái Lan đã đạt được thành tích này năm lần (vào các năm 1985, 1995, 1997, 2007 và 2013), trong khi Việt Nam đạt được hai lần vào các năm 2019 và 2021. Hơn nữa, họ là hai quốc gia duy nhất đã giành tất cả các huy chương vàng trong lịch sử giải bóng đá nữ SEA Games đã được tổ chức.
