Lần gần nhất, ngày 18/4/2025, ông Thành bị cấm tham gia 4 trận và nộp phạt 20 triệu đồng sau hành vi lăng mạ tổ trọng tài trong trận HAGL thua Hà Tĩnh 0-1. Cụ thể, ông cùng trưởng đoàn Nguyễn Tấn Anh đã tự ý xông vào phòng trọng tài, to tiếng và có lời lẽ xúc phạm do bất mãn khi bàn thắng của Minh Vương không được công nhận sau khi trọng tài xem VAR. Đây là án phạt nặng, mang tính răn đe mạnh mẽ từ VFF.
Trước đó, vào tháng 5/2024, ông Thành cũng đã bị phạt 20 triệu đồng vì công khai chỉ trích lãnh đạo VPF và VFF trong buổi họp báo sau trận gặp TP.HCM. Dù phát ngôn mang tính tiêu cực, nhưng ông chỉ bị phạt tiền vì VFF cho rằng hành vi chưa đủ nghiêm trọng để áp dụng án cấm chỉ đạo, tránh ảnh hưởng đến đội bóng.
Lần trước đó nữa ông Vũ Tiến Thành bị kỷ luật là vào tháng 4/2023, khi còn dẫn dắt CLB TP.HCM. Sau nhiều phát ngôn gây sốc như gọi Cúp Quốc gia là "giải phường", tố cáo “có nhóm trọng tài bị thao túng”, công kích Chủ tịch Hà Nội FC, ông bị cảnh cáo và phạt 10 triệu đồng. VPF khi đó còn phải ra công văn yêu cầu CLB TP.HCM nhắc nhở ông Thành.
Ba lần bị phạt liên tiếp phản ánh mối quan hệ đầy căng thẳng giữa HLV Vũ Tiến Thành và các cơ quan tổ chức bóng đá tại Việt Nam, cũng như cho thấy những ranh giới mỏng manh giữa tự do phát biểu và hành vi phi thể thao trong môi trường bóng đá chuyên nghiệp.
